真菌的种类凡多，致病率极高，是生物界中的一大类群，数目至少在十万种以上，其中能引起人或动物感染的约占三百种左右。直菌按菌落可分为霉菌和酵母菌两大类，能引起人或动物感染的真菌分为病原真菌和条件致病菌两大类。病原真菌本身具致病性，而条件致病菌一般情况下不致病，只有在一定条件下，即当机体免疫力下降时才引起致病。有的真菌只侵犯皮肤，有的只侵犯内脏，有的即侵犯皮肤又侵犯粘膜。因此真菌病有的以发病部位命名如头癣、脚癣、手癣、体癣等。有的则按皮肤损害的形态命名如叠癣。有的则以致病菌命名如念珠菌病等。
习惯上将真菌按照侵犯的部位分为：
一、浅表真菌病：真菌仅侵犯体表角质层如花斑癣、马拉巴菌毛囊炎等。
二、皮肤癣菌病：仅侵犯表皮浅层，极少引起皮下组织的病变，不引起内脏损害，如头癣、体癣、股癣、手癣、足癣、甲癣等。
三、皮下组织真菌病：即侵犯皮肤和皮下组织，也可侵犯内脏，如着色真菌病、孢子丝菌病等。
四、系统性真菌病：以侵犯内脏为主，如念珠菌病等。
防治原则及措施：
一、改善内环境：在治疗真菌病时，要注意调整、纠正内环境，如避免长期大量应用广谱抗生素、皮质激素和免疫抑制剂，积极治疗体内可诱发、加重真菌病的一些慢性疾病，不偏食或嗜食高糖食品，注意减肥，使内环境维持正常化。
二、改善外环境：真菌对营养条件的要求不高，如遇合适的温度及湿度即可大量繁殖。工作、居室等环境的湿热，穿着透气不良的鞋袜或衣服以及体表潮湿、摩擦（如腹股沟、腋下及肥胖者皮肤皱褶等处），均为真菌繁殖的最佳场所。
三、消毒应彻底：绝大多数真菌有耐受不良环境的能力，可以在离体后附着在衣物、鞋袜等表面，在常温下不会因短期的干燥或“营养不良”而死亡，致病性真菌在38度以上环境中才能停止生长，一般洗涤或日光照射也不能将其杀死， 因此对患者污染的衣物、鞋袜，应进行烫洗或用有效的药液泡洗才能达到将真菌杀死，避免再感染的目的。
四、治疗要恰当：小范围的浅表真菌病以外用药为主，大范围的浅部皮肤真菌应外用药与内用药结合，系统性真菌病应以内用药为主。
五、适时停药：临床上最常见到的是病人在癣病严重，痒不可耐或继发细菌感染、出现严重症状时，才予以重视而认真治疗，一旦症状缓解，他们就“稍有好转忘了痒”而不坚持继续治疗，待到再次加重时，则抱怨医生医术不高，治不好病或认为药物疗效不佳。其实这样的病人从来没有达到治愈的标准，应该经过治疗后，即达到临床症状的治愈，又达到真菌学检查阴性，此后才能逐渐减少用药次数，按不同癣病情况维持治疗一定时间后，才可停药。
六、真菌病的预防：控制传染源，阻断传播途径。避免直接或间接接触传染源，如患者及患癣动物。对公共场所的用品及病人均应予消毒。加强个人预防，保持皮肤清洁干燥，勤洗澡，勤晒被服，勿吃霉变食物。长期服用广谱抗生素、皮质激素及免疫抑制剂者，应定期进行痰、尿、鼻腔分泌物真菌的培养检查，并预防性服用抗真菌的药物。